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北京艾德莱植物RNA/microRNA提取产品选择指南   点击次数:1249次
北京艾德莱植物RNA提取产品选择指南:
植物千变万化,种类繁多,非常复杂,世界上任何一家公司任何一种试剂盒也无法确保100%提取成功。因此选择推荐植物RNA提取试剂盒必须多和客户,技术人员沟通。
A: TRIzol可以提取的植物样品
首先询问客户的样品是否曾经用别的试剂或者试剂盒提取过的植物样品,TRIzol是否可以提取成功?如果TRIzol可以提取成功的样品:
(1)       首先有两种选择:第一是用我们的RN01 TRIpure reagent,这个就是InvitrogenTRIzol,我们质量完全和进口一样可以100%替代进口TRIzol第二是用RN33 PLANTpure 通用植物总RNA快速提取试剂盒(普通植物组织细胞),这个试剂盒的原理,成分和RN03完全一样,也是TRIzol加离心柱子,在TRIzol的基础上加了离心柱子,速度更快,纯度更高,操作更简单。等于是TRIpureRN01)加离心柱子。
(2)       然后根据客户的特殊具体需求比如想速度更快,操作更简单,还不想用TRIzol这种苯酚,氯仿毒性物质的客户还有两种选择:一种选择是RN52 EASYspin通用植物RNA提取试剂盒,这个盒子和天根的DP432 RNAprep pure植物总RNA提取试剂盒一样,不用苯酚,氯仿,速度最快,操作最简单,带DNA酶柱上消化,得到的RNA可以直接做荧光定量PCR可以提取包括水稻、玉米、小麦、拟南芥、番茄、烟草和棉花等多糖多酚少的简单植物样品。比天根的优点在于适应性更广泛,纯度更高。另外一种是选择RN09 EASYspin植物RNA提取试剂盒,这个试剂盒是不带DNA酶柱上消化的,和qiagen74904 RNeasy plant mini kit 一样,但是本试剂盒适应性更广泛,一般多糖多酚的如冬青,梅花,杨树,月季,玫瑰,茶花也都可以提取,但是不带DNA酶柱上消化,更适合只做普通的反转录和克隆。如果知道用户使用天根的DP432,全式金的ER301-01则对应我们的RN52,如用户使用qiagen74904对应我们RN09
 
B: TRIzol无法提取的植物样品
如果客户说,他们曾经用过TRIzol,但是TRIzol无法提取成功,或者没有用过TRIzol,但是知道TRIzol无法提取成功的样品,说明是比较复杂的多糖多酚的样品,那么RN01,RN33trizol原理的是肯定不行了。别无选择只有三个可能推荐:
(1)       叶片、花瓣、花芽类比较叶片类的种类包括象葡萄叶子,杨树叶子,棉花叶片类类代谢产物多酚丰富的种类相对简单,可以用RN38 EASYspin Plus植物RNA提取试剂盒提取(RN38RN09的升级版,加了一根基因组DNA清除柱子,一般可以清除DNA到电泳肉眼不可见),如果RN38提取产量低,可以用RN38的同一个盒子按照RN09的步骤提取可能提高产量(略去基因组清除柱步骤可能提高产量);如果RN38或者RN09提取残留肉眼可见的基因组DNA,可以按照RN09步骤提取并加一个DNA酶柱上消化的步骤(货号:RN34)来清除残留DNA
(2)        如稻谷种子,百合鳞茎,葡萄果实,唐菖蒲的球茎,中草药块根等复杂多糖多酚色素淀粉含量特别大,这一类很难提取,只能尝试RN53 EASYspin Plus多糖多酚/复杂植物RNA提取试剂盒
(3)        其它公司试剂盒已经提取失败或者产量低的复杂植物,首先尝试RN53 EASYspin Plus多糖多酚/复杂植物RNA提取试剂盒。例如天根的DP441多糖多酚植物总RNA提取试剂盒提取失败的或者要替换天根DP441
申请了专利的植物RNA100miRNA
 
客户部分成功样品列表(还在不断增长中):棉花、海棠、黑加仑、烟草、拟南芥、虎杖、大豆、草莓、冬青、月季花雌蕊、蔷薇、沙棘、冬枣、芦荟、仙人掌、报春花、水稻、玉米、唐菖蒲、樱桃、白玉兰、毛白杨、樱花、葡萄、百合花、百合叶子雌蕊雄蕊、紫菜、绿藻、香蕉、水仙花、青花菜、地被菊、苹果、梅花、番茄、石斛、毛桃、苎麻、慈姑、葛根、甘肃桃、玫瑰花、槟榔果、甜糖菊、硅藻、牡丹、胡杨、油桐果、梨子皮、板栗花序、青皮云杉、红树根、铁线蕨、黄瓜、小麦叶子种子、番木瓜、甘薯、紫薯、油松、油茶、马尾松、芜菁、毛果杨、木薯、大叶落地生根、山杏、旱柳、桉树、琵琶花果、麻风树,沙生槐、荞麦。
发表文章100多篇,请参考后面发表文章列表。
北京艾德莱植物microRNA/TrizolmicroRNA
 
1. Trizol 可以提取的植物样品。
推荐RN05-RNAmisi microRNA快速提取试剂盒 ,这个是Trizol类原理的方法来提取microRNA,只要Trizol可以提取的样品,都可以用这款来提取microRNA。对应天根的DP501和Qiagen的217004,我们的和他们的原理方法完全一样,我们的优点在于,我们比Qiagen的更好在我们有两套柱子,除了提取包括microRNA的总RNA, 我们还可以分提RNA和microRNA,也就是专门分离富集microRNA,不需要再花钱买一个试剂盒来富集microRNA了。
 
2. Trizol 不可以提取的植物样品。
推荐RN40-EASYspin 植物microRNA快速提取试剂盒 ,这是我们的世界首创,独家的产品,它没有竞争对手,天根,全式金,omega,qiagen,takara这些公司都没有这种原理方法的植物RNA提取试剂盒, 他们只有Trizol类原理的植物microRNA提取试剂盒,也就是等于我们的RN05,  microRNA提取试剂盒,这款的原理是用Trizol类的,苯酚氯仿类的原理,Trizol能提取的植物样品,可以用它来提取microRNA,但是,大家知道,很多植物样品是无法用trizol来提取的,所以,这款Trizol原理类的microRNA试剂盒对于这种trizol无法提取的植物样品不要说microRNA了,就是RNA都无法提取。所以,全世界只有我们一家有这款试剂盒。 如果客户说这款产品为啥贵一些,你就要给客户解释一下, 别家的试剂盒原理是Trizol类的,是用苯酚/氯仿类原理的,这款因为很简单,所以,它比较便宜,但它是无法提取复杂多糖多酚样品植物的microRNA的,如果你要这款便宜的,我们也有,就是我们的RN05 RNAmisi microRNA提取试剂盒这款,而且,确保和Qiagen的质量一样甚至更好,你要便宜,这款我们有的, 可以更便宜。但是这款Trizol类原理的是无法提取复杂植物样品的,就是进口Qiagen的也无法提取的。不要说microRNA了, Trizol复杂样品的总RNA都无法提取, 怎么可能能提取microRNA呢? 所以,便宜但是无法用的。而我们的RN4001, 是我们世界独创的不用Trizol/苯酚/氯仿毒性物质原理的植物microRNA提取试剂盒, 可以提取包括复杂植物样品microRNA的一切样品,适合做microRNA测序,高通量测序,建库等各种流行应用,而且,已经有4篇发表文章(可以看说明书附录)包括复杂的丹参等样品。
附录4:使用RN40 EASYspin植物microRNA快速提取试剂盒的部分发表文章:
1.毛泡桐:Dynamic expression of novel and conserved microRNAs and their targets in diploidand tetraploid of Paulownia tomentosa. Biochimie 2014, 102: 68–77
2.丹参:Genome-wide analysis and molecular dissection of the SPL gene family in Salvia miltiorrhiza. J Integr Plant Biol 2013, 56: 38–50
3.短葶飞蓬Transcriptomic comparison of the selfpollinated and cross-pollinated flowers of Erigeron breviscapus to analyze candidate self-incompatibility-associated genes. BMC Plant Biology 2015, 15: 248
4.梧桐树:Identification and Functional Analysis of MicroRNAs and Their Targets in Platanus acerifolia under Lead (Pb) Stress. Int. J. Mol. Sci. 2015, 16: 7098-7111 
最后,客户在不知道我们的情况下,用Qiagen,天根的Trizol类 microRNA盒子提取失败的情况下,没有办法,只能用Trizol或者手工方法做,但是Trizol/手工方法的异丙醇乙醇沉淀无法充分沉淀微小的microRNA,所以会丢失大量的microRNA,但是客户没有办法,只能凑合用 。我们这个时候,可以给客户讲清楚道理,客户只要经费允许,是愿意花1个天根普通microRNA提取试剂盒的钱来买一个真正管用的植物microRNA盒子的!
RETRACTED: Cell Adhesion-Dependent Control of MicroRNA Decay
1 School of Biological Sciences, Seoul National University, Seoul 151-742, Korea
2 Bioinformatics Institute, Seoul National University, Seoul 151-742, Korea
·                     This article has been retracted: please see Elsevier Policy on Article Withdrawal (http://www.elsevier.com/locate/withdrawalpolicy).This article has been retracted at the request of the Editor-in-Chief and Author.In this paper, we reported that the levels of specific microRNAs (miRNAs) decrease when cells are grown at low density or when cells are detached from a culture dish. Based on our results, we proposed that some miRNAs are selectively destabilized depending on the adhesion status of the cells. However, in subsequent studies, we discovered that structured miRNAs with low GC content are selectively lost during sample preparation, particularly when a small number of cells is used for RNA preparation using the standard TRIzol protocol (see the Letter to the Editor published in this issue for details). These findings provide an alternative explanation for our original data. While the original data are all reproducible, we are retracting the paper because we feel the main conclusions have been compromised. We apologize for any inconvenience this may have caused.
 
 
                    
 
 
 
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