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艾德莱DNA提取产品选择指南   点击次数:6551次

 


北京艾德莱生物DNA提取产品选择指南

首先询问客户提取的大致种类,是动物组织细胞?植物?血液样品?真菌?细菌?病毒?酵母?不同的种类应该选择不同的产品。

 

注意:所有的核酸分离产品,可以提供大量提取的盒子规格,即使目录没有写,也可以一样价格定做。

 

血液样品

注意:北京艾德莱溶液型的血液基因组DNA提取,小量(DN02),中量(DN03),大量(DN04)这三种盒子里面成分实际完全一样,就是分量不同,然后配了小量,中量,大量3种不同样品处理量的说明书。任何一种盒子,都可以按照比例放大或者缩小提取,小量,中量,大量或者说任意量的血液样品。也就是说小量的比如0.3ml x 50次的盒子,一次提取0.3ml可以提取50次,也可以一次提取3ml可以提取5次,也可以一次提取5ml可以提取3次。大量的比如10ml x 16次,一次提取10ml可以提取16次,也可以一次提取1ml可以提取160次,也可以一次提取0.3ml可以533次。中量的盒子以此次类推。

A: 新鲜的抗凝血液或者冰箱冻存的抗凝血液(抗凝良好,未凝固)

(1)       样品<200µl首选DN01 小量全血基因组DNA快速提取试剂盒(离心柱型)。离心柱型速度快,方便。次选DN02 小量全血基因组DNA提取试剂盒(溶液型)。溶液型稍繁琐对操作要求高些,但是便宜,和可以提取更大分子量的基因组DNA,更适合建文库使用。

(2)       样品>200µl 但是<500µl首选DN01 小量全血基因组DNA快速提取试剂盒(离心柱型)。但是需要同时定购一个红细胞裂解液。次选DN02 小量全血基因组DNA提取试剂盒(溶液型)。

(3)       样品>500µl 但是<20ml:样品超过500µl尤其是超过1ml的情况下,一般会超出小量离心柱子处理范围,因此一般不能选用离心柱型的DN01,而要选择溶液型的产品如DN03DN04,具体选择哪款就看总共处理多大量了, 比如一次提取1ml 但是要提取60个样品, 就可以选择中量DN03,如果一次提取1ml,但是要提取160个样品,可以选择大量DN04,当然也可以选择3个中量的盒子,就是贵了不合算。如果一次提取10ml,但是只提取5个样品,也可以选择中量的DN03,选择大量的最小包装也可以提取10ml x 16次,就浪费了。


B:
抗凝不完全导致含有血凝块血液(凝固血)

(1)       样品<200µl首选DN01 小量全血基因组DNA快速提取试剂盒(离心柱型)。就是添加一个操作,在操作前用枪头捣碎血凝块后按照正常步骤进行。 次选DN31凝固全血基因组DNA提取系统。

(2)       样品>200µl 但是<500µl首选DN01 小量全血基因组DNA快速提取试剂盒(离心柱型)。但是需要同时定购一个红细胞裂解液,捣碎血凝块后先用红细胞裂解液处理后按照正常步骤进行,可以问我们索取专门用于凝固血的DN01的说明书(凝固血专用)。次选DN31凝固全血基因组DNA提取系统。

(3)       样品>500µl 但是<20ml:样品超过500µl尤其是超过1ml的情况下,一般会超出小量离心柱子处理范围,因此一般不能选用离心柱型的DN01 只能选择DN31凝固全血基因组DNA提取系统。

 

总结:一般200µl左右的小量血液提取,首先推荐DN01,超过0.5ml尤其是超过1ml血液只能选择溶液型的中量DN03和大量DN04血液提取。全血基因组DNA提取为优势产品,比起其他公司如天根产品有明显优势,离心柱型的纯度高,可用于芯片制作。溶液型的技术也更好,和凯杰qiagen,罗氏roche,普洛麦格promega的原理配方说明书操作完全一样,不用蛋白酶K消化,(天根并未掌握改技术,还是用蛋白酶K消化,所以纯度低,步骤繁琐)。无论是离心柱型还是溶液型血液基因组DNA提取产品,艾德莱生物提取DNA均可用于芯片制作。是一个明显优势。

 

 

植物

植物千变万化,种类繁多,非常复杂,世界上任何一家公司任何一种试剂盒也无法确保100%提取成功。下面分别介绍几个植物DNA提取试剂盒。

DN14 CTAB植物基因组DNA快速提取试剂盒 这个是传统CTAB法植物DNA提取方法的改良,并添加了离心柱子设计,简化了操作步骤,缩短了操作时间,提高了纯度。优点在于适应性广泛,包括很多复杂的多糖多酚,次级代谢产物丰富的或者干粉植物样品也可以提取。缺点是用到了氯仿毒性物质。和DN15(新型植物基因组DNA快速提取试剂盒)比较起来提取速度也稍微要慢一些。对应天根生化的货号是DP305植物基因组DNA提取试剂盒。

 

DN15 新型植物基因组DNA快速提取试剂盒 这个是世界上目前最快速,无毒的植物DNA提取试剂盒。相当于Qiagen DNeasy plant mini kit (Qiagen货号:69104),原理,配方,操作步骤几乎完全一致,说明书都可以通用。优点是操作最简单,速度最快,而且不用氯仿等毒性物质。缺点是适应性或者广泛性差一些,和DN14比较起来,对于某些多糖多酚次级代谢复杂或者干燥保存的植物样品效果可能不理想。一般更多用于新鲜,简单的植物样品(比如棉花、烟草、水稻、玉米、小麦、拟南芥等农作物)。对应天根生化的货号是DP320 新型植物基因组DNA提取试剂盒。

 

DN34快捷型植物基因组DNA提取试剂盒-I  这个就是DN15的简化版本,为了节约成本,给客户一个更多的选择,DN15减少离心柱子的版本就是DN34。不过一般不加离心柱子后,操作速度和和效果会比DN15要差一些。优点是溶液型的,可以任意的放大,缩小处理量,可以灵活用于小量,中量,大量提取。对应天根生化的货号是DP321快捷型植物基因组DNA提取系统

 

总结:一般情况下,首先选择DN14DN15产品。具体又分两种情况:一种情况客户自己知道原来用的方法或者用过天根同类试剂盒的,可以问客户原来是使用什么方法或者试剂盒提取。如果是用传统的CTAB法手工提取或者客户以前使用的是天根的DP305,就可以推荐我们的DN14。如果客户以前是用Qiagen69104或者使用天根的DP320,就可以推荐我们的DN15。另一种情况是客户以前没有用过试剂盒或者也没有用过CTAB法手工提取,就是完全不知道怎么选择的情况下, 如果是棉花、烟草、水稻、玉米、小麦、拟南芥等简单样品或者茶树叶片、苹果叶片、梨树叶片、桉树叶片等提取过确定可以提取的情况下肯定可以首选推荐DN15 ,如果客户的样品明显是复杂多糖多酚,次级代谢产物多或者是干燥保存样品,那就首先推荐DN14。如果分不清楚是复杂多糖多酚样品还是简单样品,可以务必事先和艾德莱技术支持沟通,看看如何推荐。

 

真菌样品

1. 首选DN41真菌DNA提取试剂盒(相当于DN15)

2. 实际上DN41真菌DNA提取试剂盒=DN15新型植物基因组DNA快速提取试剂盒,没错,真菌本来就是应该用DN15新型植物基因组DNA快速提取试剂盒来提取的(进口qiagen试剂盒都是植物DNA提取试剂盒提取真菌的)。 这个盒子DN41(DN15一样)Qiagen69104 DNeasy plant mini kit完全一样。客户要搞不清楚就下原版qiagen的说明书看看就行了,确保DN15Qiagen69104一样。但是如果碰到特别复杂的真菌种类,多糖多酚代谢产物特别复杂,DN41(DN15)效果不好,就要试试DN14 CTAB植物基因组DNA快速提取试剂盒。

下面是Qiagen网站的69104的介绍:

http://www.qiagen.com/products/genomicdnastabilizationpurification/dneasyplantsystem/dneasyplantminikit.aspx?LanguageID=CN#Tabs=t0

DNeasy Plant Mini Kit

植物细胞,组织或真菌细胞样品分离总DNA,最高产量可达 30 µg

DNA,无污染物和酶抑制剂

快速纯化得到即用型DNA

无需有机抽提,无需乙醇沉淀

 

组织细胞、鼠尾、软骨、昆虫、等样品(包括保存在酒精里面的)

小量提取首选DN07组织/细胞基因组DNA快速提取试剂盒

中量,大量提取首选DN08组织/细胞基因组DNA提取试剂盒(溶液型)

细菌样品

无论革兰氏阳性菌还是阴性菌首选DN11细菌基因组DNA快速提取试剂盒;中量大量可以选择DN13中量/大量细菌基因组DNA提取试剂盒

酵母样品

小量提取首选DN20酵母基因组DNA快速提取试剂盒(离心柱型)

中量,大量提取首选DN29中量/大量酵母基因组DNA提取试剂盒 (溶液型)

病毒DNA样品(从血浆,血清,体液等无细胞体系)

DN4001 病毒DNA提取试剂盒,另外也可以用RN22病毒基因组DNA/RNA快速提取试剂盒II

粪便样品

DN23粪便基因组DNA快速提取试剂盒原理,方法,操作和QiagenQIAamp DNA Stool Mini KitQiagen 货号:51504)完全一致。

http://www.qiagen.com/products/genomicdnastabilizationpurification/qiaampsystem/qiaampdnastoolminikit.aspx

QIAamp DNA Stool Mini Kit

用于从粪便中纯化最多30 μg 基因组、细菌、病毒和寄生虫DNA

快速纯化高品质,即用型DNA

无有机提取或乙醇沉淀

持续的高产量

彻底去除污染物和下游反应抑制物

  

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